Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM25Q14258 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM25Q14258 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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