Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms