Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms