Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CDK13Q14004 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
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