Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H3Q13889 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H3Q13889 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms