Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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LAMB3Q13751 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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LAMB3Q13751 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LAMB3Q13751 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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