Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEUROD1Q13562 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NEUROD1Q13562 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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