Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EIF4EBP1Q13541 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms