Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP140Q13342 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP140Q13342 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SP140Q13342 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP140Q13342 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP140Q13342 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP140Q13342 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP140Q13342 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP140Q13342 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP140Q13342 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP140Q13342 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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SP140Q13342 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SP140Q13342 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SP140Q13342 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SP140Q13342 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SP140Q13342 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP140Q13342 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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SP140Q13342 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP140Q13342 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP140Q13342 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP140Q13342 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SP140Q13342 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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