Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIGQ13278 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIGQ13278 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIGQ13278 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIGQ13278 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIGQ13278 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIGQ13278 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIGQ13278 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIGQ13278 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIGQ13278 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIGQ13278 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIGQ13278 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RIGQ13278 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RIGQ13278 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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