Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTGDRQ13258 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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PTGDRQ13258 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGDRQ13258 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms