Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF5Q13243 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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