Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME3Q13232 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NME3Q13232 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME3Q13232 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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NME3Q13232 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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NME3Q13232 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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NME3Q13232 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME3Q13232 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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