Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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