Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RESTQ13127 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RESTQ13127 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RESTQ13127 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RESTQ13127 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RESTQ13127 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms