Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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TRAF1Q13077 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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TRAF1Q13077 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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TRAF1Q13077 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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TRAF1Q13077 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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TRAF1Q13077 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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TRAF1Q13077 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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TRAF1Q13077 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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