Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPRL3Q12980 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPRL3Q12980 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms