Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GRIN2AQ12879 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
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