Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SREBF2Q12772 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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