Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms