Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTDSPL2Q05D32 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTDSPL2Q05D32 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms