Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7AQ04656 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms