Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN1Q04323 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms