Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ID3Q02535 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ID3Q02535 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms