Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLCB3Q01970 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLCB3Q01970 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms