Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC6A3Q01959 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms