Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms