Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms