Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms