Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2BP78356 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2BP78356 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms