Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HBBP68871 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HBBP68871 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HBBP68871 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HBBP68871 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HBBP68871 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HBBP68871 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HBBP68871 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HBBP68871 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HBBP68871 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HBBP68871 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HBBP68871 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HBBP68871 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HBBP68871 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HBBP68871 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HBBP68871 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms