Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms