Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPEP62304 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPEP62304 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPEP62304 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms