Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UFM1P61960 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UFM1P61960 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms