Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms