Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PROK1P58294 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PROK1P58294 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PROK1P58294 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PROK1P58294 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PROK1P58294 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PROK1P58294 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PROK1P58294 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PROK1P58294 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms