Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms