Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2BFSP57053 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms