Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP7P55210 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP7P55210 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASP7P55210 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASP7P55210 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP7P55210 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms