Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FGF8P55075 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FGF8P55075 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF8P55075 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF8P55075 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF8P55075 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF8P55075 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF8P55075 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF8P55075 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms