Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ETV1P50549 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ETV1P50549 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms