Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK8P49336 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK8P49336 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK8P49336 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK8P49336 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms