Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2AP48426 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms