Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPZBP47756 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPZBP47756 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPZBP47756 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPZBP47756 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPZBP47756 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPZBP47756 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPZBP47756 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPZBP47756 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPZBP47756 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPZBP47756 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPZBP47756 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms