Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF5P43026 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GDF5P43026 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GDF5P43026 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms