Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXLNAP40222 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TXLNAP40222 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TXLNAP40222 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXLNAP40222 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms