Protein–RNA interactions for Protein: P35367

HRH1, Histamine H1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH1P35367 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRH1P35367 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HRH1P35367 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRH1P35367 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HRH1P35367 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HRH1P35367 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HRH1P35367 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HRH1P35367 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HRH1P35367 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HRH1P35367 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HRH1P35367 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HRH1P35367 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HRH1P35367 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HRH1P35367 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRH1P35367 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms