Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP2C19P33261 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP2C19P33261 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms