Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM5AP29375 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5AP29375 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms