Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB5P28074 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms